Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkar1aQ9DBC7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms