Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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