Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms