Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms