Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms