Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms