Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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