Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rpl4Q9D8E6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rpl4Q9D8E6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl4Q9D8E6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms