Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms