Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms