Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms