Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms