Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms