Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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