Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms