Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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