Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Mrpl28Q9D1B9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl28Q9D1B9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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