Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hddc3Q9D114 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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