Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mms19Q9D071 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Mms19Q9D071 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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