Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms