Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nip7Q9CXK8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms