Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xrcc3Q9CXE6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Xrcc3Q9CXE6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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