Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ddx28Q9CWT6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ddx28Q9CWT6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ddx28Q9CWT6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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