Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnot11Q9CWN7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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