Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms