Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nicn1Q9CQM0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nicn1Q9CQM0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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