Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms