Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms