Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nudt21Q9CQF3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms