Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gtf2a1Q99PM3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms