Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arl4dQ99PE9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms