Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms