Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6cQ99N08 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms