Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramel1Q99MW3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramel1Q99MW3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramel1Q99MW3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms