Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms