Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RtcbQ99LF4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RtcbQ99LF4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms