Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnajb11Q99KV1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnajb11Q99KV1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms