Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ciao1Q99KN2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms