Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps4Q99KG7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps4Q99KG7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms