Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms