Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms