Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msantd4Q91YU3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms