Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf6Q91YR7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms