Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cabp4Q8VHC5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cabp4Q8VHC5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cabp4Q8VHC5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cabp4Q8VHC5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cabp4Q8VHC5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms