Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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