Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rprd1aQ8VDS4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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