Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms