Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms