Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1mtQ8R4U6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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