Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms